Религией этих изчезнувших цивилизаций был политеизм с довольно обширным и сложным пантеоном богов, сведения о котором не всегда достоверны и противоречивы по вполне понятным причинам (испанские и португальские миссионеры постарались...)
Но вот для примера некоторые боги этого пантеона:
Изображение Кецалькоатля (Пернатого Змея, одного из главных богов) из кодекса Мальябенчьяно (Codex Magliabechiano), XVI в.
Кецалькоатль и Тескатлипока (другой бог из пантеона древних Ацтеков), Codex Borbonicus, XV в.
Отголоски древних религий видны в странных и необычных культах современных потомков древних индейцев, они причудливо сочетают в себе черты католического христианства, древнего шаманизма и культа Пернатого Змея. Похожи на религию Вуду (или мне так показалось, это ИМХО).